Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

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Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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RubcnlQ3TD16 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
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RubcnlQ3TD16 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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RubcnlQ3TD16 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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RubcnlQ3TD16 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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RubcnlQ3TD16 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RubcnlQ3TD16 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
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RubcnlQ3TD16 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
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RubcnlQ3TD16 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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RubcnlQ3TD16 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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RubcnlQ3TD16 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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RubcnlQ3TD16 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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RubcnlQ3TD16 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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RubcnlQ3TD16 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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RubcnlQ3TD16 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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RubcnlQ3TD16 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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RubcnlQ3TD16 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RubcnlQ3TD16 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms