Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Prr27Q3SYJ2 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms