Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Treml4Q3LRV9 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Treml4Q3LRV9 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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