Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptcd3Q14C51 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptcd3Q14C51 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms