Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Traf3ip1Q149C2 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
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Traf3ip1Q149C2 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
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Traf3ip1Q149C2 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms