Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc162pQ0VG85 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms