Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Samd12Q0VE29 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Samd12Q0VE29 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Samd12Q0VE29 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Samd12Q0VE29 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Samd12Q0VE29 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Samd12Q0VE29 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Samd12Q0VE29 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Samd12Q0VE29 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Samd12Q0VE29 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Samd12Q0VE29 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Samd12Q0VE29 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Samd12Q0VE29 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Samd12Q0VE29 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Samd12Q0VE29 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Samd12Q0VE29 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Samd12Q0VE29 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Samd12Q0VE29 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Samd12Q0VE29 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Samd12Q0VE29 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Samd12Q0VE29 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Samd12Q0VE29 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Samd12Q0VE29 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Samd12Q0VE29 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Samd12Q0VE29 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Samd12Q0VE29 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Samd12Q0VE29 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Samd12Q0VE29 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Samd12Q0VE29 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Samd12Q0VE29 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Samd12Q0VE29 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Samd12Q0VE29 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Samd12Q0VE29 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Samd12Q0VE29 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Samd12Q0VE29 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Samd12Q0VE29 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Samd12Q0VE29 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Samd12Q0VE29 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Samd12Q0VE29 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Samd12Q0VE29 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Samd12Q0VE29 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Samd12Q0VE29 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Samd12Q0VE29 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Samd12Q0VE29 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Samd12Q0VE29 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Samd12Q0VE29 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Samd12Q0VE29 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Samd12Q0VE29 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Samd12Q0VE29 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Samd12Q0VE29 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Samd12Q0VE29 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Samd12Q0VE29 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Samd12Q0VE29 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Samd12Q0VE29 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Samd12Q0VE29 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Samd12Q0VE29 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Samd12Q0VE29 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Samd12Q0VE29 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Samd12Q0VE29 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Samd12Q0VE29 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Samd12Q0VE29 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Samd12Q0VE29 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Samd12Q0VE29 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Samd12Q0VE29 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Samd12Q0VE29 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Samd12Q0VE29 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Samd12Q0VE29 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Samd12Q0VE29 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Samd12Q0VE29 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms