Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms