Protein–RNA interactions for Protein: Q0II04

Nebl, Nebulette, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeblQ0II04 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NeblQ0II04 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms