Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttc21bQ0HA38 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms