Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms