Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms