Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms