Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bp2Q06649 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.8 ms