Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Prrx2Q06348 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Prrx2Q06348 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms