Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms