Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CkbQ04447 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CkbQ04447 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CkbQ04447 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CkbQ04447 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CkbQ04447 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CkbQ04447 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CkbQ04447 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms