Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Msx2Q03358 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.2 ms