Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GscQ02591 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GscQ02591 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GscQ02591 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GscQ02591 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GscQ02591 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GscQ02591 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
GscQ02591 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GscQ02591 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GscQ02591 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GscQ02591 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GscQ02591 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GscQ02591 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GscQ02591 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GscQ02591 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GscQ02591 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GscQ02591 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GscQ02591 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GscQ02591 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GscQ02591 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GscQ02591 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GscQ02591 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GscQ02591 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GscQ02591 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GscQ02591 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GscQ02591 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GscQ02591 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GscQ02591 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GscQ02591 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GscQ02591 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GscQ02591 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GscQ02591 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GscQ02591 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GscQ02591 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GscQ02591 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GscQ02591 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GscQ02591 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GscQ02591 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GscQ02591 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GscQ02591 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GscQ02591 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GscQ02591 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GscQ02591 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GscQ02591 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GscQ02591 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GscQ02591 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GscQ02591 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GscQ02591 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GscQ02591 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GscQ02591 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GscQ02591 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GscQ02591 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GscQ02591 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GscQ02591 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GscQ02591 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GscQ02591 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GscQ02591 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GscQ02591 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GscQ02591 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GscQ02591 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GscQ02591 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GscQ02591 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GscQ02591 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GscQ02591 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GscQ02591 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GscQ02591 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GscQ02591 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GscQ02591 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GscQ02591 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GscQ02591 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GscQ02591 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GscQ02591 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GscQ02591 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GscQ02591 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GscQ02591 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GscQ02591 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GscQ02591 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GscQ02591 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GscQ02591 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GscQ02591 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GscQ02591 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GscQ02591 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GscQ02591 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GscQ02591 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GscQ02591 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GscQ02591 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GscQ02591 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GscQ02591 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GscQ02591 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GscQ02591 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GscQ02591 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GscQ02591 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GscQ02591 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GscQ02591 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GscQ02591 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GscQ02591 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GscQ02591 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GscQ02591 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GscQ02591 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GscQ02591 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms