Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VcpQ01853 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VcpQ01853 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VcpQ01853 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VcpQ01853 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VcpQ01853 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VcpQ01853 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VcpQ01853 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VcpQ01853 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VcpQ01853 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms