Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms