Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itga4Q00651 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itga4Q00651 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms