Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GabpaQ00422 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms