Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shc1P98083 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shc1P98083 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shc1P98083 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shc1P98083 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Shc1P98083 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shc1P98083 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shc1P98083 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shc1P98083 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shc1P98083 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shc1P98083 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shc1P98083 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms