Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarcc1P97496 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms