Protein–RNA interactions for Protein: P97473

Tarbp2, RISC-loading complex subunit TARBP2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp2P97473 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms