Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smyd1P97443 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms