Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tubg1P83887 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms