Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gabpb2P81069 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gabpb2P81069 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gabpb2P81069 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gabpb2P81069 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gabpb2P81069 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabpb2P81069 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabpb2P81069 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabpb2P81069 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabpb2P81069 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabpb2P81069 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabpb2P81069 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabpb2P81069 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabpb2P81069 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabpb2P81069 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabpb2P81069 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabpb2P81069 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabpb2P81069 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabpb2P81069 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabpb2P81069 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabpb2P81069 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabpb2P81069 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabpb2P81069 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabpb2P81069 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabpb2P81069 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabpb2P81069 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabpb2P81069 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabpb2P81069 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabpb2P81069 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabpb2P81069 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabpb2P81069 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabpb2P81069 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabpb2P81069 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabpb2P81069 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabpb2P81069 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabpb2P81069 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabpb2P81069 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabpb2P81069 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabpb2P81069 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabpb2P81069 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabpb2P81069 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabpb2P81069 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabpb2P81069 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabpb2P81069 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabpb2P81069 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabpb2P81069 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabpb2P81069 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabpb2P81069 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabpb2P81069 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabpb2P81069 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabpb2P81069 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabpb2P81069 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabpb2P81069 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabpb2P81069 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabpb2P81069 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabpb2P81069 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabpb2P81069 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabpb2P81069 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms