Protein–RNA interactions for Protein: P70663

Sparcl1, SPARC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 650 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sparcl1P70663 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sparcl1P70663 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms