Protein–RNA interactions for Protein: P70339

Frat1, Proto-oncogene FRAT1, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frat1P70339 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frat1P70339 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frat1P70339 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frat1P70339 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frat1P70339 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frat1P70339 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frat1P70339 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frat1P70339 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frat1P70339 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frat1P70339 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frat1P70339 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frat1P70339 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frat1P70339 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Frat1P70339 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Frat1P70339 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Frat1P70339 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Frat1P70339 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Frat1P70339 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Frat1P70339 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Frat1P70339 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Frat1P70339 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Frat1P70339 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Frat1P70339 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Frat1P70339 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Frat1P70339 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Frat1P70339 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Frat1P70339 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Frat1P70339 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Frat1P70339 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frat1P70339 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frat1P70339 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Frat1P70339 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frat1P70339 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frat1P70339 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frat1P70339 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frat1P70339 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frat1P70339 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms