Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cux2P70298 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cux2P70298 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cux2P70298 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cux2P70298 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cux2P70298 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cux2P70298 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Cux2P70298 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cux2P70298 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cux2P70298 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cux2P70298 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms