Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Traf5P70191 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Traf5P70191 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Traf5P70191 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Traf5P70191 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Traf5P70191 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Traf5P70191 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Traf5P70191 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Traf5P70191 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Traf5P70191 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Traf5P70191 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Traf5P70191 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Traf5P70191 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Traf5P70191 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Traf5P70191 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf5P70191 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf5P70191 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf5P70191 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf5P70191 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf5P70191 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf5P70191 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf5P70191 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Traf5P70191 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Traf5P70191 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Traf5P70191 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms