Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb4bP68372 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms