Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SnrpfP62307 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141 ms