Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rps11P62281 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rps11P62281 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rps11P62281 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rps11P62281 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rps11P62281 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rps11P62281 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rps11P62281 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rps11P62281 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rps11P62281 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Rps11P62281 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Rps11P62281 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Rps11P62281 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Rps11P62281 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Rps11P62281 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rps11P62281 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rps11P62281 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rps11P62281 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rps11P62281 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rps11P62281 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rps11P62281 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rps11P62281 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rps11P62281 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rps11P62281 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rps11P62281 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rps11P62281 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rps11P62281 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rps11P62281 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rps11P62281 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rps11P62281 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rps11P62281 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rps11P62281 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rps11P62281 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
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