Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
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Lmo4P61969 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms