Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga11P61622 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga11P61622 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga11P61622 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga11P61622 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga11P61622 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga11P61622 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga11P61622 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga11P61622 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Itga11P61622 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga11P61622 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga11P61622 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga11P61622 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Itga11P61622 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga11P61622 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga11P61622 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga11P61622 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga11P61622 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga11P61622 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga11P61622 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga11P61622 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga11P61622 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga11P61622 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga11P61622 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga11P61622 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga11P61622 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Itga11P61622 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Itga11P61622 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Itga11P61622 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Itga11P61622 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Itga11P61622 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Itga11P61622 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Itga11P61622 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Itga11P61622 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Itga11P61622 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Itga11P61622 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Itga11P61622 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Itga11P61622 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Itga11P61622 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Itga11P61622 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Itga11P61622 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Itga11P61622 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Itga11P61622 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Itga11P61622 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Itga11P61622 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Itga11P61622 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Itga11P61622 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Itga11P61622 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Itga11P61622 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Itga11P61622 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Itga11P61622 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Itga11P61622 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Itga11P61622 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Itga11P61622 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Itga11P61622 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Itga11P61622 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Itga11P61622 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Itga11P61622 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Itga11P61622 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Itga11P61622 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Itga11P61622 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Itga11P61622 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Itga11P61622 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Itga11P61622 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Itga11P61622 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Itga11P61622 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Itga11P61622 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Itga11P61622 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Itga11P61622 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Itga11P61622 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Itga11P61622 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms