Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sem1P60897 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sem1P60897 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sem1P60897 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sem1P60897 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sem1P60897 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sem1P60897 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sem1P60897 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sem1P60897 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sem1P60897 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sem1P60897 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sem1P60897 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sem1P60897 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sem1P60897 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sem1P60897 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sem1P60897 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sem1P60897 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sem1P60897 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sem1P60897 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sem1P60897 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sem1P60897 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sem1P60897 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sem1P60897 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sem1P60897 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sem1P60897 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sem1P60897 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sem1P60897 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sem1P60897 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sem1P60897 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sem1P60897 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sem1P60897 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sem1P60897 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sem1P60897 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sem1P60897 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sem1P60897 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sem1P60897 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sem1P60897 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sem1P60897 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sem1P60897 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sem1P60897 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sem1P60897 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sem1P60897 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sem1P60897 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sem1P60897 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sem1P60897 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sem1P60897 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sem1P60897 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sem1P60897 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sem1P60897 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sem1P60897 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sem1P60897 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sem1P60897 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sem1P60897 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sem1P60897 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sem1P60897 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sem1P60897 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sem1P60897 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sem1P60897 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sem1P60897 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sem1P60897 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sem1P60897 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sem1P60897 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sem1P60897 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sem1P60897 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sem1P60897 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sem1P60897 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sem1P60897 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sem1P60897 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sem1P60897 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sem1P60897 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sem1P60897 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sem1P60897 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sem1P60897 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sem1P60897 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sem1P60897 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sem1P60897 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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