Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms