Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms