Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Setd4P58467 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Setd4P58467 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Setd4P58467 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Setd4P58467 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Setd4P58467 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Setd4P58467 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Setd4P58467 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Setd4P58467 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Setd4P58467 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Setd4P58467 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Setd4P58467 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Setd4P58467 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Setd4P58467 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Setd4P58467 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Setd4P58467 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Setd4P58467 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Setd4P58467 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Setd4P58467 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Setd4P58467 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Setd4P58467 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Setd4P58467 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Setd4P58467 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Setd4P58467 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Setd4P58467 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Setd4P58467 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Setd4P58467 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Setd4P58467 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Setd4P58467 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Setd4P58467 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Setd4P58467 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Setd4P58467 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Setd4P58467 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Setd4P58467 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Setd4P58467 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Setd4P58467 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Setd4P58467 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Setd4P58467 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Setd4P58467 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms