Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp25P57080 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp25P57080 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp25P57080 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp25P57080 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp25P57080 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp25P57080 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms