Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bace1P56818 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bace1P56818 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Bace1P56818 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bace1P56818 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bace1P56818 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bace1P56818 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bace1P56818 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bace1P56818 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Bace1P56818 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Bace1P56818 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bace1P56818 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bace1P56818 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bace1P56818 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms