Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TdgP56581 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TdgP56581 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TdgP56581 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TdgP56581 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TdgP56581 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TdgP56581 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TdgP56581 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TdgP56581 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TdgP56581 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TdgP56581 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TdgP56581 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TdgP56581 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TdgP56581 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TdgP56581 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TdgP56581 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TdgP56581 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TdgP56581 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TdgP56581 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TdgP56581 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TdgP56581 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TdgP56581 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TdgP56581 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TdgP56581 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TdgP56581 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TdgP56581 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TdgP56581 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TdgP56581 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TdgP56581 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TdgP56581 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TdgP56581 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TdgP56581 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TdgP56581 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TdgP56581 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TdgP56581 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TdgP56581 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TdgP56581 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TdgP56581 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TdgP56581 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TdgP56581 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TdgP56581 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TdgP56581 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TdgP56581 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TdgP56581 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TdgP56581 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TdgP56581 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TdgP56581 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TdgP56581 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TdgP56581 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TdgP56581 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TdgP56581 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TdgP56581 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TdgP56581 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TdgP56581 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TdgP56581 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TdgP56581 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TdgP56581 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TdgP56581 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TdgP56581 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TdgP56581 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TdgP56581 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TdgP56581 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TdgP56581 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TdgP56581 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TdgP56581 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TdgP56581 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TdgP56581 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TdgP56581 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TdgP56581 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TdgP56581 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TdgP56581 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TdgP56581 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TdgP56581 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TdgP56581 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TdgP56581 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TdgP56581 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TdgP56581 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TdgP56581 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TdgP56581 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TdgP56581 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TdgP56581 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TdgP56581 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TdgP56581 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TdgP56581 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TdgP56581 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TdgP56581 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TdgP56581 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TdgP56581 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TdgP56581 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TdgP56581 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TdgP56581 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TdgP56581 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TdgP56581 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TdgP56581 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TdgP56581 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TdgP56581 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TdgP56581 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TdgP56581 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TdgP56581 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TdgP56581 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms