Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NcanP55066 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NcanP55066 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NcanP55066 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NcanP55066 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NcanP55066 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NcanP55066 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NcanP55066 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NcanP55066 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NcanP55066 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NcanP55066 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NcanP55066 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NcanP55066 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NcanP55066 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NcanP55066 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NcanP55066 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NcanP55066 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NcanP55066 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NcanP55066 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NcanP55066 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NcanP55066 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NcanP55066 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NcanP55066 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NcanP55066 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NcanP55066 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NcanP55066 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NcanP55066 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NcanP55066 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NcanP55066 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NcanP55066 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NcanP55066 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NcanP55066 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NcanP55066 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NcanP55066 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NcanP55066 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NcanP55066 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NcanP55066 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NcanP55066 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NcanP55066 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NcanP55066 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NcanP55066 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NcanP55066 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NcanP55066 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NcanP55066 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NcanP55066 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NcanP55066 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NcanP55066 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NcanP55066 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NcanP55066 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NcanP55066 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NcanP55066 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NcanP55066 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NcanP55066 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NcanP55066 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NcanP55066 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NcanP55066 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NcanP55066 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NcanP55066 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NcanP55066 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NcanP55066 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NcanP55066 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NcanP55066 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NcanP55066 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NcanP55066 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NcanP55066 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NcanP55066 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NcanP55066 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NcanP55066 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NcanP55066 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NcanP55066 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NcanP55066 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NcanP55066 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NcanP55066 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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NcanP55066 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NcanP55066 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NcanP55066 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NcanP55066 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NcanP55066 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NcanP55066 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NcanP55066 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NcanP55066 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NcanP55066 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NcanP55066 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NcanP55066 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NcanP55066 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NcanP55066 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NcanP55066 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NcanP55066 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NcanP55066 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NcanP55066 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NcanP55066 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NcanP55066 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NcanP55066 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NcanP55066 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NcanP55066 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NcanP55066 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NcanP55066 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NcanP55066 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NcanP55066 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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