Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms