Protein–RNA interactions for Protein: P52950

Dbx1, Homeobox protein DBX1, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dbx1P52950 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Dbx1P52950 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Dbx1P52950 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Dbx1P52950 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dbx1P52950 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Dbx1P52950 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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