Protein–RNA interactions for Protein: P51163

Uros, Uroporphyrinogen-III synthase, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UrosP51163 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UrosP51163 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UrosP51163 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UrosP51163 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UrosP51163 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UrosP51163 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UrosP51163 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UrosP51163 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UrosP51163 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UrosP51163 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UrosP51163 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UrosP51163 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UrosP51163 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UrosP51163 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UrosP51163 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UrosP51163 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UrosP51163 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UrosP51163 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UrosP51163 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UrosP51163 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UrosP51163 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UrosP51163 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UrosP51163 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UrosP51163 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UrosP51163 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UrosP51163 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UrosP51163 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UrosP51163 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UrosP51163 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
UrosP51163 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UrosP51163 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
UrosP51163 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UrosP51163 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UrosP51163 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UrosP51163 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UrosP51163 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UrosP51163 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UrosP51163 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UrosP51163 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UrosP51163 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UrosP51163 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UrosP51163 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UrosP51163 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UrosP51163 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UrosP51163 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UrosP51163 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UrosP51163 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UrosP51163 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UrosP51163 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UrosP51163 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UrosP51163 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UrosP51163 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UrosP51163 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UrosP51163 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UrosP51163 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UrosP51163 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UrosP51163 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UrosP51163 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UrosP51163 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UrosP51163 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
UrosP51163 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UrosP51163 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
UrosP51163 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UrosP51163 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
UrosP51163 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UrosP51163 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UrosP51163 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UrosP51163 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UrosP51163 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UrosP51163 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UrosP51163 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UrosP51163 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UrosP51163 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UrosP51163 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UrosP51163 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UrosP51163 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UrosP51163 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UrosP51163 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UrosP51163 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UrosP51163 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UrosP51163 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UrosP51163 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UrosP51163 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UrosP51163 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UrosP51163 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
UrosP51163 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
UrosP51163 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
UrosP51163 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UrosP51163 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UrosP51163 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UrosP51163 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UrosP51163 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UrosP51163 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UrosP51163 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UrosP51163 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UrosP51163 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UrosP51163 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UrosP51163 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UrosP51163 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UrosP51163 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms