Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpbP50405 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpbP50405 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SftpbP50405 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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SftpbP50405 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SftpbP50405 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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SftpbP50405 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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SftpbP50405 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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SftpbP50405 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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SftpbP50405 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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SftpbP50405 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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SftpbP50405 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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SftpbP50405 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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SftpbP50405 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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SftpbP50405 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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SftpbP50405 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SftpbP50405 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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